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제목	[Caits Lee] AP Bio 질문있습니다.
제가 여러가지 질문이 있어서 죄송합니다... 첫번째는 ampR gene 이 어떻게 recombinant gene 남기고 다 지우는건가요? 그리고, Bacteria 를 써서 Gene cloning 을 해도, 어떻게 인간에게 쓰이나요? 제가 또 잘 이해를 못한게 Genomic Library 인데. 이게 무슨 용도로 쓰이고, 프레젠테이션에는 3가지 종류가 있다고 나오는데, 각각 쓰이는 용도가 달른가요? pGLO가 그 LacZ 아이디어는 똑같은건가요? 제가 LacZ 는 이해를 했는데, pGLO 는 이해를 잘 못했네요. 그리고 지금 할 질문은 이번 강의랑 연관성이 없는데, 제가 다니는 학교는 AP 코스가 없어서 그냥 강의로 시험을 볼려고 하는데, 어떻게 공부를 해야하나요? 제가 지금 공부하면서, 계속 전에 배웠던거 까먹고 있는데... 이거 괜찮은건가요? 아니면 처음부터 또 다시 배워야하나요? 제가 공부하면서 정확히 어디까지 암기를 해야하는지 잘몰라서... 추천하는 FLASH CARD같은거 있나요? 질문이 많아서 죄송합니다... 항상 도움주셔서 감사합니다.
2019-01-18 오전 9:18:25 안녕하세요~ 첫번째는 ampR gene 이 어떻게 recombinant gene 남기고 다 지우는건가요? --> 아닙니다. ampicilin 이라는 항생제 ( antibiotics ) 가 ampR 을 포함한 recombinant plasmid 을 uptake 해서 transformation한 박테리아만 남기고 나머지 untransformed 박테리아는 다 죽이는 겁니다. 그리고, Bacteria 를 써서 Gene cloning 을 해도, 어떻게 인간에게 쓰이나요? --> 인간이 필요로 하는 growth hormone gene 을 아예 박테리아에 insert 한셈이니 박테리아가 transcription, translation을 해서 빠른속도로, 대량으로 protein으로 만들어주면 그 protein을 가져다가 쓰는 겁니다. 다만, prokaryote은 intron, exon이 없어서 인간의 intron까지 포함된 gene을 그대로 insert 하면 문제가 되기에 complementary DNA을 처음부터 insert 해주는겁니다. (교재 참조) 제가 또 잘 이해를 못한게 Genomic Library 인데. 이게 무슨 용도로 쓰이고, 프레젠테이션에는 3가지 종류가 있다고 나오는데, 각각 쓰이는 용도가 달른가요? --> 이 부분은 ap bi o에 잘 안나오니 ( 교과서 최근 개정판에서 내용이 빠졌습니다) 너무 열심히 안하셔도 될듯합니다. genomic library란, 분석하고자 하는 유전자 전체를 잘게잘게 부분부분으로 나누어 vector에 담아둔것입니다. 이때, 무슨 vector를 사용했느냐에 따라 plamid (세균에서 추출) ( 교재에서 (a) 그림) phage (바이러스에서 추출) library 가 됩니다 ( 교재에서는 이 그림은 없지만 phage library 도 있습니다) Bacterial artificial chromosome (BAC)는 최대 20~30만 염기길이의 DNA를 운반할 수 있도록 인공적으로 만든 vector입니다. 자연계에서 얻은 vector는 그 자체의 수용량이 있기 때문에 긴 유전자를 많이 담지는 못합니다. (교재의 (B) 그림) 그렇게 만들어진 유전자를 담은 vector를 ( c) 그림처럼 한데 "mutiwell" 플라스틱 플레이트 ( 384-well plate) 에 모아둡니다. 한 well 당 하나의 gene clone 이 들어갑니다. 우리 인간의 genome이 21000개의 gene 이라고 한다면, 전체 게놈을 포함한 플레이트를 만들고 싶다면, 384 well plate가 몇개 필요할지 계산이 되겠죠? pGLO가 그 LacZ 아이디어는 똑같은건가요? 제가 LacZ 는 이해를 했는데, pGLO 는 이해를 잘 못했네요. --> 비슷합니다만 이것도 ap bio 에 안나올수 있습니다. 교과서에 안나오거던요. 실험을 하는 학교가 있길래 ( 좀 어렵게 하는 학교) 응용력을 키우게 해보고자 넣었습니다. Jump to search pGLA 는 arabinose가 있어야 발현 ( express) 되는 arabinose 소화시키는 enzyme만드는 gene 대신해 그 자리에 GFP ( green flourescent protein) 을 넣은 plasmid 입니다. pGLO을 uptake 하여 transform한 박테리아는 arabinoe 가 있는 환경에서 arabinose operon 을 turn on 해서 GFP을 만들어냅니다. UV light 아래서 초록색 형광물질을 관찰할수 있습니다. 또 BLA ( ampicilin resistant gene) 도 역시 포함하고 있어서 이 pGLO을 uptake 하여 transform한 박테리아는 ampicilin 하에서 살아남겠죠. Left: Bacteria transformed with pGLO under ambient light Right:Bacteria transformed with pGLO visualized under ultraviolet light Left: Bacteria transformed with pGLO exposed to ampicillin and ambient light Right:Bacteria transformed with pGLO exposed to ampicillin and ultraviolet light 아래 그림은 위키피디아에서 가져온겁니다. ampicilin이 없는 환경에서 모든 박테리아가 다 살아남았지만 ( 위, 왼쪽 그림) arabinose을 add했더니 transform 된 박테리아 colony만 GFP을 만들어낸것을 관찰할수 있고 ( 위, 오른쪽 그림) ampicilin이 있는 환경에서는 transform 된 박테리아colony만 살아남았고 ( 아래, 왼쪽 그림) arabinose을 add했더니 transform 된 박테리아 (살아남은 박테리아모두) colony가 GFP을 만들어낸것을 관찰할수 있습니다 ( 아래, 오른쪽 그림) 그리고 지금 할 질문은 이번 강의랑 연관성이 없는데, 제가 다니는 학교는 AP 코스가 없어서 그냥 강의로 시험을 볼려고 하는데, 어떻게 공부를 해야하나요? 제가 지금 공부하면서, 계속 전에 배웠던거 까먹고 있는데... 이거 괜찮은건가요? 아니면 처음부터 또 다시 배워야하나요? 제가 공부하면서 정확히 어디까지 암기를 해야하는지 잘몰라서... 추천하는 FLASH CARD같은거 있나요? --> 하하 까먹지 않도록 해야겠죠. 바이오가 외워서 시험보는 시험이 아니기에 flash card 로 공부하는 방법은 크게 추천하지는 않습니다만 ( flash card가 지나치게 자세히 외우도록 하더군요) 그래도 외우지 않으면 응용도 할수 없고, 어느정도 외운것을 써야하는 FRQ 는 풀 수 없는것이 사실입니다. 학교에서 ap course 듣는 애들은 저의 교재 정도의 내용은 달달 외우고 quiz, test을 학교에서 보니, 그런 아이들과 경쟁하기 위해서라도 여지껏 배운거 다시 복습하시고 어느정도 외우시기 바래요. 제 문풀 강의중에 The Essence of AP BIOLOGY 문제풀이 - practice exam ( 15강 완성) 에 full set 가 3세트 있으니 그거 수강을 미리 하면서 , 공부한걸 바탕으로 이정도로 풀수있게 나오는구나 가늠해보시고,, 최근 frq의 동향이 바뀌고 있습니다. 실험 based, 실험 설계, 실험자료 분석 문제가 8문제중 2문제 정도 나왔다고 하면 이제는 거의 8문제중 7문제가 그런식으로 나오고 있으니 최근 frq 위주로 풀어보면서 ( college board에 FRQ 미국꺼 공개, 선생님 동영상 해설 강의 있음 ( 2018 년 이번주에 찍을예정) ) 시험 분위기에 맞추어 공부하시기 바랍니다.

제목

[Caits Lee] AP Bio 질문있습니다.

Genetic Engineering 1

작성자

Par***

등록일

2019-01-16 오전 3:01:14

제가 여러가지 질문이 있어서 죄송합니다... 첫번째는 ampR gene 이 어떻게 recombinant gene 남기고 다 지우는건가요? 그리고, Bacteria 를 써서 Gene cloning 을 해도, 어떻게 인간에게 쓰이나요? 제가 또 잘 이해를 못한게 Genomic Library 인데. 이게 무슨 용도로 쓰이고, 프레젠테이션에는 3가지 종류가 있다고 나오는데, 각각 쓰이는 용도가 달른가요? pGLO가 그 LacZ 아이디어는 똑같은건가요? 제가 LacZ 는 이해를 했는데, pGLO 는 이해를 잘 못했네요.

그리고 지금 할 질문은 이번 강의랑 연관성이 없는데, 제가 다니는 학교는 AP 코스가 없어서 그냥 강의로 시험을 볼려고 하는데, 어떻게 공부를 해야하나요? 제가 지금 공부하면서, 계속 전에 배웠던거 까먹고 있는데... 이거 괜찮은건가요? 아니면 처음부터 또 다시 배워야하나요? 제가 공부하면서 정확히 어디까지 암기를 해야하는지 잘몰라서... 추천하는 FLASH CARD같은거 있나요?

질문이 많아서 죄송합니다... 항상 도움주셔서 감사합니다.

2019-01-18 오전 9:18:25

안녕하세요~

첫번째는 ampR gene 이 어떻게 recombinant gene 남기고 다 지우는건가요?

--> 아닙니다. ampicilin 이라는 항생제 ( antibiotics ) 가 ampR 을 포함한 recombinant plasmid 을 uptake 해서 transformation한 박테리아만 남기고 나머지 untransformed 박테리아는 다 죽이는 겁니다.

그리고, Bacteria 를 써서 Gene cloning 을 해도, 어떻게 인간에게 쓰이나요?

--> 인간이 필요로 하는 growth hormone gene 을 아예 박테리아에 insert 한셈이니 박테리아가 transcription, translation을 해서 빠른속도로, 대량으로 protein으로 만들어주면 그 protein을 가져다가 쓰는 겁니다. 다만, prokaryote은 intron, exon이 없어서 인간의 intron까지 포함된 gene을 그대로 insert 하면 문제가 되기에 complementary DNA을 처음부터 insert 해주는겁니다. (교재 참조)

제가 또 잘 이해를 못한게 Genomic Library 인데. 이게 무슨 용도로 쓰이고, 프레젠테이션에는 3가지 종류가 있다고 나오는데, 각각 쓰이는 용도가 달른가요? --> 이 부분은 ap bi o에 잘 안나오니 ( 교과서 최근 개정판에서 내용이 빠졌습니다) 너무 열심히 안하셔도 될듯합니다.

genomic library란, 분석하고자 하는 유전자 전체를 잘게잘게 부분부분으로 나누어 vector에 담아둔것입니다.

이때, 무슨 vector를 사용했느냐에 따라 plamid (세균에서 추출) ( 교재에서 (a) 그림) phage (바이러스에서 추출) library 가 됩니다 ( 교재에서는 이 그림은 없지만 phage library 도 있습니다)

Bacterial artificial chromosome (BAC)는 최대 20~30만 염기길이의 DNA를 운반할 수 있도록 인공적으로 만든 vector입니다. 자연계에서 얻은 vector는 그 자체의 수용량이 있기 때문에 긴 유전자를 많이 담지는 못합니다. (교재의 (B) 그림)

그렇게 만들어진 유전자를 담은 vector를 ( c) 그림처럼 한데 "mutiwell" 플라스틱 플레이트 ( 384-well plate) 에 모아둡니다. 한 well 당 하나의 gene clone 이 들어갑니다. 우리 인간의 genome이 21000개의 gene 이라고 한다면, 전체 게놈을 포함한 플레이트를 만들고 싶다면, 384 well plate가 몇개 필요할지 계산이 되겠죠?

pGLO가 그 LacZ 아이디어는 똑같은건가요? 제가 LacZ 는 이해를 했는데, pGLO 는 이해를 잘 못했네요.

--> 비슷합니다만 이것도 ap bio 에 안나올수 있습니다. 교과서에 안나오거던요. 실험을 하는 학교가 있길래 ( 좀 어렵게 하는 학교) 응용력을 키우게 해보고자 넣었습니다.

Jump to search pGLA 는 arabinose가 있어야 발현 ( express) 되는 arabinose 소화시키는 enzyme만드는 gene 대신해 그 자리에 GFP ( green flourescent protein) 을 넣은 plasmid 입니다. pGLO을 uptake 하여 transform한 박테리아는 arabinoe 가 있는 환경에서 arabinose operon 을 turn on 해서 GFP을 만들어냅니다. UV light 아래서 초록색 형광물질을 관찰할수 있습니다. 또 BLA ( ampicilin resistant gene) 도 역시 포함하고 있어서 이 pGLO을 uptake 하여 transform한 박테리아는 ampicilin 하에서 살아남겠죠.

Left: Bacteria transformed with pGLO under ambient light
Right:Bacteria transformed with pGLO visualized under ultraviolet light

Left: Bacteria transformed with pGLO exposed to ampicillin and ambient light
Right:Bacteria transformed with pGLO exposed to ampicillin and ultraviolet light

아래 그림은 위키피디아에서 가져온겁니다. ampicilin이 없는 환경에서 모든 박테리아가 다 살아남았지만 ( 위, 왼쪽 그림) arabinose을 add했더니 transform 된 박테리아 colony만 GFP을 만들어낸것을 관찰할수 있고 ( 위, 오른쪽 그림)

ampicilin이 있는 환경에서는 transform 된 박테리아colony만 살아남았고 ( 아래, 왼쪽 그림)

arabinose을 add했더니 transform 된 박테리아 (살아남은 박테리아모두) colony가 GFP을 만들어낸것을 관찰할수 있습니다 ( 아래, 오른쪽 그림)

--> 하하 까먹지 않도록 해야겠죠. 바이오가 외워서 시험보는 시험이 아니기에 flash card 로 공부하는 방법은 크게 추천하지는 않습니다만 ( flash card가 지나치게 자세히 외우도록 하더군요) 그래도 외우지 않으면 응용도 할수 없고, 어느정도 외운것을 써야하는 FRQ 는 풀 수 없는것이 사실입니다. 학교에서 ap course 듣는 애들은 저의 교재 정도의 내용은 달달 외우고 quiz, test을 학교에서 보니, 그런 아이들과 경쟁하기 위해서라도 여지껏 배운거 다시 복습하시고 어느정도 외우시기 바래요.

제 문풀 강의중에 The Essence of AP BIOLOGY 문제풀이 - practice exam ( 15강 완성) 에 full set 가 3세트 있으니 그거 수강을 미리 하면서 , 공부한걸 바탕으로 이정도로 풀수있게 나오는구나 가늠해보시고,,

최근 frq의 동향이 바뀌고 있습니다. 실험 based, 실험 설계, 실험자료 분석 문제가 8문제중 2문제 정도 나왔다고 하면 이제는 거의 8문제중 7문제가 그런식으로 나오고 있으니 최근 frq 위주로 풀어보면서 ( college board에 FRQ 미국꺼 공개, 선생님 동영상 해설 강의 있음 ( 2018 년 이번주에 찍을예정) ) 시험 분위기에 맞추어 공부하시기 바랍니다.